Diseño in silico de un vector de edición genética en fresa (Fragaria vesca) para la resistencia a Botrytis cinerea
DOI:
https://doi.org/10.25127/riagrop.20262.1191Palabras clave:
Fragaria vesca, Botrytis cinerea, CRISPRa, dCas9-VP64, SnRK1, activación génicaResumen
La fresa (Fragaria vesca) es un cultivo de alto valor económico y nutricional, susceptible a infecciones por Botrytis cinerea, un patógeno fúngico que ocasiona pérdidas severas en calidad y rendimiento. Debido al uso excesivo de fungicidas y al aumento de cepas resistentes, se exploraron estrategias biotecnológicas alternativas. En este estudio, se diseñó un vector de edición genética para inducir la sobreexpresión del gen FaSnRK1α, conocido por activar la vía de defensa mediada por ácido salicílico. Se identificó la secuencia codificante de FvSnRK1α en la base de datos Phytozome y se realizó un análisis filogenético con especies relacionadas. Posteriormente, se diseñaron ARN guías (sgRNA) específicas mediante CHOPCHOP, considerando eficiencia mayor al 60 %, posición en la región promotora, sin off-targets y baja autocomplementariedad. Se seleccionaron tres sgRNAs candidatos y se construyó in silico un vector binario con el gen dCas9-VP64 bajo el promotor CaMV 35S, los sgRNA bajo promotores U6, y el gen de selección nptII. La estructura fue verificada como vector funcional para activación dirigida de genes. Estos resultados demuestran que el diseño racional de vectores CRISPRa en fresa puede ser una herramienta eficaz para mejorar la resistencia genética frente a B. cinerea mediante sobreexpresión controlada de genes defensivos.
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Derechos de autor 2026 Linder Ramírez-Viena, Carlos Pesantes-Rojas, Mao Yupanqui-Celestino
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